建设合同管理的工作程序，合同管理是一个动态的管理过程，从策划、合同签订到合同实施以及实施过程中的索赔，可分为不同的阶段进行管理。
1.合同策划阶段
策划阶段的管理是项目管理的重要组成部分，是在项目实施前对整个项目合同管理方案预先做出科学合理的安排和设计，从合同管理组织、方法、制度、内容等方面预先做出计划的方案，以保证项目所有合同的圆满履行，减少合同争议和纠纷，从而保证整个项目目标的实现。合同策划大致包括以下内容：
(1)项目合同管理组织机构及人员配备。
(2)项目合同管理责任及其分解体系。
(3)项目合同管理方案设计，具体包括以下几个方面：
①项目发包模式选择;
②合同类型选择;
③项目分解结构及编码体系;
④合同结构体系(合同分解、标段划分);
⑤招标方案设计;
⑥招标文件设计;
⑦合同文件设计;
⑧主要合同管理流程设计，包括投资控制流程、工期控制流程、质量控制流程、设计变更流程、支付与结算管理流程、竣工验收流程、合同索赔流程、合同争议处理流程等。
2.合同签订阶段
合同签订阶段一般包括招投标、合同审查、合同谈判、合同订立四个基本阶段。
在一般的买卖合同或服务合同中，只要交易双方就合同权利、义务达成一致，合同便成立，而建设工程并非如此，尤其是施工合同，合同的签订首先要经过招投标，选定合适的承包商。
在确定中标单位之后，还必须通过合同谈判，将双方在招投标过程中达成的协议具体化或做出某些增补或删减，对价格等所有合同条款进行法律认证，最终订立一份对双方均有法律约束力的合同文件，此时合同签订才算完成。由此可见，建设工程施工合同的签订要遵循严格的程序，不能一蹴而就。
3.合同实施阶段
合同的实施就是要求工程建设项目的发包人和承包人根据合同规定的时间、地点、方式、内容及标准等要求，各自完成合同义务的行为。
建设工程合同的实施可分为合同分析、合同控制、合同变更管理、合同信息管理几个方面。作为合同的当事人，双方的义务都不是单一的最后交付行为，而是一系列义务的总和。
尤其作为施工合同，发包方不仅要按时支付工程备料款、进度款，还要按约定按时提供现场施工条件，及时参加隐蔽工程验收等;而承包方义务的多样性则表现为工程质量必须达到合同约定标准，施工进度不能超过合同工期等。
可见，建设合同的实施，其内容丰富、持续时间长，是其他合同不能比拟的。
4.索赔管理
工程索赔通常是指在工程合同履行过程中，合同当事人一方因非自身责任或对方不履行或未能正确履行合同而受到经济损失或权利损害时，通过一定的合法程序向对方提出经济或时间补偿的要求。
在市场经济条件下，工程索赔在工程建设市场中是一种正常的现象。
它是一种正当的权利要求，是发包人、工程师和承包人之间一项正常的、大量发生而且普遍存在的合同管理业务，是一种以法律和合同为依据的、合情合理的行为。
工程索赔在国际工程建设市场上是合同当事人保护自身正当权益、弥补工程损失、提高经济效益的重要的、有效的手段。
但在我国，对工程索赔的认识不够全面、正确，在土木工程施工中，还存在着业主忌讳索赔、承包人索赔意识不强、监理工程师不懂如何处理索赔的现象。
因此，应加强对索赔理论和方法的研究，认真对待和做好工程索赔工作。
